Le Fort Fleur d’Epée est bâti à la fin de la guerre de Sept Ans, au départ des Anglais, en 1763. Les failles du Fort Louis dans son système de défense apparaissent évidentes et le projet d’un fort annexe, celui de Fleur d’Epée, est amorcé : une grande batterie avec 18 canons à gros calibres est érigée.

Le fort passe à nouveau sous le contrôle britannique du général Grey en avril 1794. En juillet de la même année, Victor Hugues, commissaire chargé de faire appliquer l’abolition de l’esclavage dans les colonies françaises s’empare du fort avec 3000 esclaves libérés devenus soldats.
Sous Bonaparte, le traité de paix avec l’Angleterre est finalement rompu entraînant à nouveau des conflits franco-britanniques en Guadeloupe aboutissant à l’occupation anglaise entre 1810 et 1815, et à des affrontements jusqu’à la moitié du XIXème siècle.

Le Fort Fleur d’Epée s’en voit grandement dégradé et est finalement abandonné du fait de sa situation géographique éloignée de la mer et de l’amélioration des systèmes d’artillerie rendant de nombreuses fortifications inopérantes.

Au moment de la départementalisation, en 1946, le Fort Fleur d’Epée devient propriété du Conseil Général et, suite à plusieurs chantiers de rénovation, s’ouvre au public dans les années 1960 sous l’impulsion de Mario Petreluzzi, premier président de la Société d’Histoire de Guadeloupe.